Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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