Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms