Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms