Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt42Q6IFX2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt42Q6IFX2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms