Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hecw2Q6I6G8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw2Q6I6G8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms