Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scaf8Q6DID3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms