Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms