Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms