Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms