Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pkp4Q68FH0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pkp4Q68FH0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pkp4Q68FH0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pkp4Q68FH0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pkp4Q68FH0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pkp4Q68FH0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pkp4Q68FH0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pkp4Q68FH0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp4Q68FH0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pkp4Q68FH0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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