Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kiaa1549Q68FD9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kiaa1549Q68FD9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kiaa1549Q68FD9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kiaa1549Q68FD9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kiaa1549Q68FD9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms