Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arhgef39Q66JY6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms