Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms