Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja3Q64448 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms