Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Abcg1Q64343 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcg1Q64343 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms