Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf4Q64287 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf4Q64287 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf4Q64287 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Irf4Q64287 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Irf4Q64287 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf4Q64287 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf4Q64287 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Irf4Q64287 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Irf4Q64287 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf4Q64287 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf4Q64287 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Irf4Q64287 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf4Q64287 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf4Q64287 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf4Q64287 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf4Q64287 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf4Q64287 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms