Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms