Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa17Q64016 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Defa17Q64016 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa17Q64016 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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Defa17Q64016 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Defa17Q64016 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Defa17Q64016 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa17Q64016 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa17Q64016 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa17Q64016 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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