Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ss18Q62280 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ss18Q62280 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ss18Q62280 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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