Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms