Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms