Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms