Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxj1Q61660 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms