Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms