Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms