Protein–RNA interactions for Protein: Q61330

Cntn2, Contactin-2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn2Q61330 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn2Q61330 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms