Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms