Protein–RNA interactions for Protein: Q61189

Clns1a, Methylosome subunit pICln, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clns1aQ61189 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clns1aQ61189 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clns1aQ61189 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms