Protein–RNA interactions for Protein: Q61079

Sim2, Single-minded homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim2Q61079 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sim2Q61079 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sim2Q61079 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms