Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Usf1Q61069 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usf1Q61069 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usf1Q61069 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usf1Q61069 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usf1Q61069 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usf1Q61069 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Usf1Q61069 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms