Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms