Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrkQ60976 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms