Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms