Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cep250Q60952 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms