Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms