Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppp1r1bQ60829 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r1bQ60829 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms