Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms