Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms