Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SkiQ60698 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SkiQ60698 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SkiQ60698 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkiQ60698 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkiQ60698 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms