Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms