Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgaeQ60677 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms