Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms