Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr1h2Q60644 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr1h2Q60644 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr1h2Q60644 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr1h2Q60644 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr1h2Q60644 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr1h2Q60644 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr1h2Q60644 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr1h2Q60644 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr1h2Q60644 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr1h2Q60644 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr1h2Q60644 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr1h2Q60644 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr1h2Q60644 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr1h2Q60644 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms