Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdcp1Q5U462 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdcp1Q5U462 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms