Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms