Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms