Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms