Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms