Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme4Q5SSW2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms