Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AbrQ5SSL4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms